2005年，南北韓聯合製造了核武器「飛擊震天雷」，但迫於國際列強的壓力，韓朝不得已交出核武器，民族強盛的願望眼看再次落空。朝鮮少校江民吉（金勝宇 飾）不甘心屈服，擄走參與項目的金博士（孔孝珍 飾）與飛擊震天雷，韓方派出少校朴政宇（黃正敏 飾）帶隊追索，正當兩方相遇之時，一顆彗星划過天空，江、朴等人彗星的強大力量影響下透過扭曲時空來到了1572年的朝鮮……
江、朴等人機緣巧合將正在屠戮朝鮮人的女真人懾退，被朝鮮先民視爲「天軍」。當夜，一名小偷偷走了他們的武器，而這名小偷，居然是朝鮮民族英雄——李舜臣（樸重勛 飾）。此時的李舜臣武科落榜，萬念俱灰，面對失意的民族英雄和倍受女真欺凌的先民，穿越時空的韓朝兩方軍人們爲了各自的信念開始戰鬥……