所謂「鍊金術」，即通過不同組合產生「金」的技術。人工孕育「生物」的嘗試亦作爲神祕研究之一，種種實驗將在不爲人知的現代爲舞台展開故事。本故事的關鍵在於糾合了鍊金術中最高技術的產物「人工生命體（怪物）Chemy」，作爲被保管在名爲「Ride Chemy Card」的卡牌之中的101個生命體，Chemy爲模仿蚱蜢、SL（蒸汽火車）等世上存在的萬物所製造。
但是，本應被慎重保管著的它們卻突然從卡牌中冒出，一齊遭到釋放。偶然被捲入該事件的主人公爲高中生 · 一之瀨寶太郎，被託付了假面騎士Gotchard的變身腰帶「Gotchar驅動器」，與回收散落於世間的Chemy的使命。