在每一個角落都被探索完畢的世界中，唯一殘留的祕境——大洞穴「阿比斯」。
不知道延續到何方，深不見底的巨大縱向洞穴，
棲息著奇妙奇怪的生物們，
沉眠著現在的人類無法製造的貴重遺物。
「阿比斯」那充滿了不可思議的姿態吸引了人們，並驅使人們展開冒險。
如此，多次挑戰大洞穴的冒險者們，
陸續得到了「探窟家」的名號。
住在建造於阿比斯邊緣的城鎮「奧斯」的孤兒莉可，
夢想著有朝一日成爲母親那樣偉大的探窟家，並解開阿比斯的謎團。
某天，以母親萊薩的白笛被發現爲契機，
莉可決定潛入阿比斯深處。
被莉可撿到的喪失記憶的機器人雷格，
也爲了尋找自己的記憶而決定同行。
莉可在深界四層中了穿彈獸的毒。
救了莉可的，是「生骸」娜娜奇。
娜娜奇也成爲兩人的同伴，三人的冒險向著波多爾多所在的深界五層進發。
在那裡，他們遇到了一位自稱爲普魯修卡的女孩子……