斯塔克公司最新研製的天幕衛星「霍華德」即將升空，它超強的監視功能飽受爭議。而托尼·斯塔克則饒有興致地與戰爭機器詹姆士·羅德穿著各自的鎧甲進行連番驚險刺激的較量。就在此時，號稱「突擊兵」的武裝機器人入侵發射場，與鋼鐵俠和戰爭機器展開激烈的混戰。而指揮部方面，一名自稱以西結的神祕白色鎧甲人釋放出神祕生物細胞，殺害了所有眼前的生物。鋼鐵俠在與他的對決中遭遇慘敗，指揮塔也徹底毀滅。在此之後，他拒絕向神盾局匯報細節，獨自一人找到正在休假的佩珀·波茨，一同調查以西結的身份及其真實目的。
一方面，神盾局對斯塔克緊追不放；另一方面，來自暗處的敵人也接二連三向他襲來……