死神武器職業專門學校，簡稱「死武專」。其學生分爲「工匠」與「武器」。
據稱，收集99個鬼神的靈魂與1個魔女的靈魂，「武器」就會進化成最強的死神武器「DEATH SCYTHE」
以最強的「工匠」爲目標的鐮刀「工匠」瑪嘉與其「武器」SOUL二人，開始了艱辛的試煉。有同樣目標的還有暗器「工匠」BLACK STAR與「武器」務椿，和死神之子——死神•德•基德與他的武器雙槍姐妹。
三組少男少女成長的故事，伴隨著的是「死武專」的危機四伏。神祕的魔女美杜莎心懷鬼胎；死神大人不離開「死武專」寸步，似乎也是爲了隱藏天大的祕密。