長相可愛個性爽朗的獅堂光（椎名碧流 配音）、心思細膩溫柔高貴的大小姐龍崎海（吉田古奈美 配音）、智勇雙全成熟穩重的鳳凰寺風（笠原弘子 配音），命運讓這三名個性迥異的女孩相遇了，她們被選中成爲了魔法騎士，前往瀕臨崩潰的錫菲羅，拯救那裡的居民於水火之中。
支撐著錫菲羅的支柱是名叫艾美諾（緒方惠美 配音）的公主，她爲了這個城市而生，爲了這個城市而活，通過虔誠的祈禱，艾美諾保佑著錫菲羅。然而，艾美諾卻愛上了她的神官謝加圖（小杉十郎太 配音），因此而無法集中精神祈禱，錫菲羅因此而遇到了前所未有的危機，解決危機的方法只有一個，那就是殺掉艾美諾。