看到搭檔望月芽心被有著玄內樣貌的神祕男人所傷，
緬因貓獸再度開始暴走。
「不能讓你誕生在世上…」
從現實世界消失的緬因貓獸，正是歪曲本身。是擁有過於巨大力量的，毀滅世界的鑰匙——
西島大吾以及出現在望月博士之處的黑客獸，逐漸解明真相。
保證世界調和的恆常性將現在變得過於強大的緬因貓獸視爲危險，而要將其切除。
隨著暴走的緬因貓獸的出現，現實世界開始進入毀滅前的倒計時。
其所波及的地點接連發生異變。因歪曲而現身的數碼寶貝們，等待著那一時刻的來臨——
被選召的孩子們，受到異常的數碼世界排斥，返回現實世界，
卻因爲與搭檔數碼寶貝在一起而遭到人們的追趕。 ...