正在進行修業之旅的小智(松本梨香 配音)、小剛(うえだゆうじ 配音)、小遙(KAORI 配音)和小正(山田ふしぎ 配音),在前往下一個城鎮的路上迷失方向。口渴難耐的他們在荒野中偶遇巡迴表演的美麗少女洋美(眞鍋かをり 配音)及其所在的瑪麗娜劇團,於是隨著她們展開愉快的旅行。洋美是水之民的後代,她們此行的目的是將曾被海盜凡頓•綽普(藤岡弘 配音)奪去的蒼海王子的蛋送回海之神殿,神殿內則藏著水之民的珍寶海之王冠。邪惡貪婪的凡頓豈能甘心失敗,他將與洋美、小精靈護林員傑克(山寺宏一 配音)以及小智一行展開激烈的正邪爭奪戰……
本片爲神奇寶貝系列第九部電影劇場版。