娜美偶然得到一張珍獸島的地圖，據說那裡埋藏著無價的寶藏，草帽海賊團的諸位不顧喬巴的阻攔，決定向這座小島挺進。正在此時，海底火山爆發，將黃金梅利號拋向空中。機緣巧合，他們竟然被拋到了珍獸島。這個小島由會說人話的動物統治，它們的老國王麒麟獅已經仙逝，偶然跌落於此的喬巴被衆獸奉爲新的國王。喬巴拗不過衆獸，權且任職。正當珍獸島爲新國王的誕生歡欣鼓舞之時，貪婪邪惡的巴特拉伯爵及其爪牙登陸小島。爲了傳說中的「國王寶藏」，他不惜對島上的動物大開殺戒。他們也勢必和草帽海賊團發生衝突……
本片根據日本漫畫家尾田榮一郎的同名原著改編，是2002年上映的第三部動畫劇場版。