明朝末年，武當派數位高手相繼遇害。時隔多年，兇手仍然是個謎。當昔日遺孤——當俗家弟子耿玉京已長成翩翩少年時，與前來比武的東方亮不打不相識，成爲了無話不談的摯友。倏忽間，風雲再起，先是泰昌帝服用武當紅丸後暴斃，後是新任武當掌門又對耿玉京步步相逼。無奈之下，耿玉京離開了武當山，在「獨行大盜」鄭鐵崗和其孫女鄭巧兒的幫助下，祕密追查當年父母遇害的真相……在追查事情的過程中，他又先後遇到了少林僧人慧可、斷魂穀穀主盧象升、崑崙西門燕等武林人士，最後還與遼東的努爾哈赤成爲了忘年之交。當調查逐漸有了指向，昔年隱藏的真相逐漸顯露端倪時，耿玉京終於發現了努爾哈赤鯨吞中原的野心，而自己的父母當初便是因此而被害。帶著國讎和家恨，耿玉京、東方亮一行回到了武當，自此埋藏多年的謎案終於揭曉，內奸也受到了應有的懲罰。