第三季將揭開臭名昭著的犯罪組織「貓頭鷹法庭」的面紗。而印第安山的逃犯則依然逍遙法外，吉姆·戈登(本·麥肯錫 Ben McKenzie 飾)必須以哥譚賞金獵人的身份親自處理此事，他的任務是找到可怕的印第安山實驗的策劃者雨果·斯特蘭奇(黃榮亮 B.D. Wong 飾)和斯特蘭奇的實驗對象之一菲什·穆尼(賈達·萍克特·史密斯 Jada Pinkett Smith 飾)。
與此同時，哥譚市警探哈維·布洛克(多納爾·羅格 Donal Logue 飾)和哥譚市警長納撒尼爾·巴恩斯(麥可·切克利斯 Michael Chiklis 飾)仍然站在這個怪物橫行的城市打擊犯罪的最前線。此外，布魯斯·韋恩(大衛·馬佐茲 David Mazouz 飾)在他信任的管家兼導師阿爾弗雷德·潘尼沃斯(西恩·帕特維 Sean Pertwee 飾)和前韋恩企業員工盧修斯·福克斯(克里斯·喬克 Chris Chalk 飾)的幫助下，發現關於他父母的謀殺案還有更多祕密有待揭開。
而隨著這座城市陷入越來越混亂的境地，哥譚市也將繼續追隨這座城市最惡毒的惡棍的故事：企鵝人、謎語人、塞琳娜·凱爾、芭芭拉·基恩，以及塔比莎和布奇。該系列還將追隨艾薇·佩珀(麥琪·格哈 Maggie Geha 飾)的故事，她在與印第安山的怪物相遇後，發現自己重生爲一個充分利用了她魅力的年輕女性；並深入探討瘋帽匠傑維斯·泰奇(本尼迪克特·薩繆爾 Benedict Samuel 飾)的起源故事，他是一位在瘋狂邊緣搖搖欲墜的天才催眠師。