又是一年暑假到來，胖虎（木村昴 配音）和小夫（關智一 配音）慫恿大雄（大原惠 配音），讓他拜託哆啦A夢（水田山葵 配音）去尋找尚未被人類開發的祕境。在此期間，一條髒兮兮的小狗不請自來，它成功幫媽媽找到丟失的包，於是成了野比家的寵物，並得名扁扁。扁扁操縱衛星照相機拍到了神祕石像的照片，以此爲契機，大雄、哆啦A夢、胖虎、小夫以及靜香（嘉數由美 配音）組成了一支少年非洲密境探險隊。他們一路上歷經千辛萬苦，更險些丟掉性命。而當離巨神像越來越近時，小夥伴們出乎意料發現了扁扁以及一個神祕王國的祕密。原本快樂的探險變成一場兇險的戰爭，他們能否拯救那個國家嗎？
本片根據藤子•F•不二雄同名大長篇漫畫改編。