在世界的角落裡，有著這樣一種生物：它們下等且奇怪，不同於任何動植物，有自己的生命形態以及生存方式。自古以來爲人類所敬畏，不知何時開始，被稱爲「蟲」。「蟲師」這個職業便應運而生，他們對蟲進行研究，並接受人們的委託，解決由蟲引起的奇異事件。故事主人公銀古（中野裕斗 配音）就是這樣一名四處雲遊的蟲師，這一次，他要解決的是一種叫「蝕日」的蟲。
近日裡，各地均發生了日蝕現象，在太陽光被遮掩的時段里，蟲會躁動，因此有可能引發各種問題，有人會受蟲氣所害，變得畏懼日光或者失眠，有人甚至會身影消失。而最讓銀古擔心的，是由「蝕日」引發的一種棘手的異常現象……