25世紀末，廣袤無垠的深邃宇宙，神經科學研究科考船畢達哥拉斯號漫無目的地漂浮將近千年。在漫長的宇宙旅程中，以開爾文博士爲首的科考隊員和船員相繼謝世，飛船的電量僅剩15%。空蕩蕩的船艙內，迴蕩著一個頗有些蒼涼孤獨的聲音。聲音來自飛船的智慧機器人控制系統亨利，他依然保持著和卡爾文對話的習慣，亨利對自身發生的一些不可控的變化感到疑惑，似乎自己在歲月的磨礪下悄然完成了自我進化。也許亨利自身也無法想像，擁有獨立思考的能力和獨一無二的靈魂是何等重大的事件。在意識到這一點後，他嘗試著爲自己創造身體，切實感受生命的脈動……