經過艱苦的激戰,汽車人奪回飽經戰火的母星賽博坦。擎天柱表彰了大黃蜂等部下的功勳,隨即和千斤頂踏上了前往宇宙深處尋找火種源的漫長之旅。另一方面,宇宙大帝喚醒沉睡在海底的威震天(Frank Welker 配音),對他的力量進行升級,以期消滅普神,創造混沌紀元。擁有光速的威震天,氣勢洶洶向賽博坦逼近。與此同時,大黃蜂等人一面進行賽博坦的復建工作,一面防備紅蜘蛛和震盪波等人的侵襲。誰知此時,兩隻巨猙獰的出現讓一切陷入混亂。似乎感受到霸天虎的衰落,擁有原始獸性的巨猙獰沖雲霄蠢蠢欲動,爲禍四方。
賽博坦黎明的前夕,和平遠遠未曾到來,最可怕的遠古軍團即將復活……