銀魂完結篇即將上演，阪田銀時（杉田智和 配音）在影院抓住一個盜錄的電影小偷，誰知刺眼的白光之後，他卻被帶到一個頗有些陌生的世界。不遠處的江戶，曾經的繁華早已不再，高樓大廈已變成沒有人居住的廢墟。原來此刻銀時正身處五年後的未來，過去的歲月里，名爲「白詛」的神祕病毒恣意蔓延，導致世界瀕臨毀滅邊緣。他在荒蕪的街道見到了颯爽英姿的志村新八（阪口大助 配音）和武功高強的神樂（釘宮理惠 配音）。似乎未來世界的銀時當初爲調查白詛而意外死亡，新八與神樂繼承了他和萬事屋的遺址，與一切惡徒作戰。
化名阿珍的銀時回到破敗的街道和朋友們身邊，此時他仿佛背負起改變黑色未來的重大使命……