故事發生在上個世紀戰爭年代，中國遭受著日本帝國主義的侵略,非常複雜，東北松花江慘遭日本帝國軍一次慘絕人寰的屠村行動，唯獨鳳弈一人逃了出來，村里其餘的人不是被鬼子殺了，就是被他們抓了，之後，關在江城大東亞醫院地下室是實驗室里。這時，鳳弈爲了活命順江南下，就這樣逃到江城，卻餓昏在路邊。第二天醒來，發現自己已經躺在醫院的病牀上。剛開始還覺得在這裡沒什麼不好，至少能夠填飽肚子。因此，一個負責研究細菌的醫生宮海心走道病牀邊，跟鳳弈說了幾句話後，就把她帶到醫院地下室實驗室里，開始將一種「麥斯卡林病毒」注射到她身體上，隨後，非常熟手拿起一把醫用的手術小刀，在鳳弈身上亂割亂切，開始進行活體解剖實驗。這時，奄奄一息的鳳弈爲了逃出這個魔窟，她想盡辦法，卻意外發現一本《魔鬼侵蝕我身》的日記，裡面記錄著醫院所有不可告人的祕密。
3年前，日本731部隊，細菌實驗支隊部長太田大佐殺了江城醫院的院長，然後，利用左院長的身份控制醫院，之後，開始利用江城的流動人口進行活體解剖，將細菌注射入到身體裡，令細菌在人體裡培養繁殖。一到夜裡，地下室就傳出驚悚詭異魔鬼般的慘叫聲。令醫院新來的醫生都以爲是醫院鬧鬼。不久，江城的流動人口經常無故失蹤，路上的人也越來越少，就連平時許多在街上晃悠的小乞丐都不見了。警察開始介入調查，在他們抽絲剝繭的調查下，卻引來了一連串的風波。與此同時，醫院來了一批實習生，我黨地下黨員志同來的第二天，鳳鸞把日記給了志同夠就死了，警方懷疑是靜秋殺了鳳鸞，因爲目擊現場的護士說，就是靜秋手握一把醫用的手術小刀在鳳鸞身體上亂割亂切，渾身是血地站在鳳鸞旁邊。
後來，經歷了一番波折後，隨著志同不斷抽絲剝繭，事情逐漸明朗，太田大佐的身份暴露，終於揭穿了這場驚天的病菌實驗陰謀。最後，醫院的人都被注射了傳染性強的細菌，爲了以免影響全城的人也被傳染，於是，他們決定與日本人同歸於盡。