故事敘述一個巧妙的契機，在泰瑞進入飛哥小佛家五周年紀念日當天，飛哥做了一個用大型鴨嘴獸羽毛球機器，而且兩人就坐在裡頭，在陰錯陽差之下撞上了背著兩人駕著火箭車出任務的泰瑞，意外彈到了杜芬舒斯家中，飛哥與小佛因此結識了杜芬舒斯，並幫杜芬舒斯修好被他們撞爛的」超時空終結者」，剛好泰瑞在此時闖進杜芬舒斯家，因爲不能被家中主人發現，所以只好變回毫無威脅性的鴨嘴獸。飛哥幫忙修好機器後，一行人進入了另一個時空。那個時空是一個被穿黑袍的獨眼杜芬舒斯獨裁統治的三州地區，莫來管隊長則成了獨眼杜芬舒斯底下的助理。
獨眼杜芬舒斯把自己那個時空的鴨嘴獸泰瑞給改造成了自己的邪惡部屬，而此時泰瑞也在情急之下暴露了自己的身分，祕密特務的身分讓飛哥很不諒解，他把泰瑞當成家人，而家人是不該有祕密的，獨眼杜芬舒斯命令機械鴨嘴獸去攻擊鴨嘴獸泰瑞，在經過一番纏鬥之後暫時甩掉了他，但鴨嘴獸泰瑞卻想獨自去對付獨眼杜芬舒斯卻失敗被俘，飛哥想回到自己的時空，但是時空終結者的遙控器卻失靈了，於是他們去找屬於那個時空的自己，卻發現另一個自己卻和本身判若兩人，毫無想像力，而且不知道暑假是什麼。
於是他們又去找了那個時空的伊莎貝拉，發現伊莎貝拉是杜芬反抗軍的一名軍官，而飛哥的朋友們在那個時空也都成了反抗軍的一員，凱蒂斯則是反抗軍頭領。另一方面獨眼杜芬舒斯聽了杜芬舒斯所敘述的另一個三州地區，於是想利用時空終結者到飛哥本來的時空進行大規模侵略，但是杜芬舒斯卻忘了怎麼啓動，獨眼杜芬舒斯只好利用手上的鴨嘴獸泰瑞當人質把飛哥他們全抓過來，杜芬舒斯在此時想起了如何改造，開啓了時空之門，但獨眼杜芬舒斯卻因爲杜芬舒斯過於懦弱，所以把他連同飛哥他們一起送去餵怪獸，此時那個時空的凱蒂斯救了他們，並用時空之門展開大逃亡。
逃回了自己的時空，卻發現獨眼杜芬舒斯的機器大軍也入侵了自己的家園，於是他們找到藏在家裡的密道，找到鴨嘴獸泰瑞留下來的祕密武器，原來是飛哥他們在暑假做的所有發明，兩個時空的人用飛哥的發明合力擊退了獨眼杜芬舒斯的機械軍團，飛哥摧毀了機器人的主控制台，讓機器人全部當機，而壓嘴獸泰瑞也打敗了機械泰瑞，消除它的邪惡思想。杜芬舒斯用獨眼杜芬舒斯最心愛的玩具火車頭把他引回屬於他的時空，並被反抗軍和莫來管所擒。
因爲泰瑞暴露了自己的身分，所以必須遣往別處，凱爾建議用杜芬舒斯的記憶終結者消除他們的記憶，飛哥因爲這一連串經歷過於精彩所以捨不得刪除，但小佛提醒他美好的記憶可以自己創造，但泰瑞只有一隻，所以選擇刪除記憶，一切又回復正常。(在記意刪除前,伊莎貝拉親了飛哥一下)