《深海探奇》以小海龜回歸大海爲主線，徐徐揭開美麗而神祕的海洋面紗……色彩繽紛的珊瑚礁、無邊無際的海帶森林、迷人的西班牙舞者、美麗而脆弱的葉狀海龍……這些令人驚奇的美妙景色和珍稀奇異的海底生物，無時無刻不在訴說著海洋母親的博大和多彩。然而美麗的背後，常常也伴隨著兇險與殘酷。頑皮的海獅遇上兇狠的大白鯊而在劫難逃，雄性石斑魚之間的戰爭永無止盡，魚兒總是無法逃脫蠍子魚狡猾的把戲，智勇雙全的殺人鯨總是不經意的出現，毒性極強的海蛇能輕易的使獵物斃命，寬吻海豚媽媽爲保護寶寶而與鯊魚展開殊死較量，長鬚鯨一口就能吞下整個魚羣，就連看似溫柔美麗的水母也能殺人於無形……捕食與被捕食的畫面每天都在上演，自然法則讓海洋生物世世代代的不斷繁衍、生息和消亡。同樣，海洋世界裡也存在和諧與安寧：看似兇狠醜陋的虎鯊也有作爲母親溫柔的一面; 印魚會清潔鰩魚身上的寄生蟲作爲免費搭乘的回報; 水母庇護著小魚們逃脫劫難; 小丑魚也找到了海葵做爲最佳搭檔……巨大而優雅的鰩魚有鳥兒一樣自由的翅膀; 胖胖的海牛竟是海洋哺乳類中唯一的素食者; 聰明可愛的海豚則是海洋家族中的完美精靈……
大海深處的未知和驚喜時刻吸引著小海龜不斷的前行。
經歷了神祕莫測的深海之旅以後，小海龜終於回到了生命開始的地方，變成了一個真正的母親。完成使命後重返大海繼續她的生命之旅。