4年了，距離那場私人武裝組織——天人與人類聯盟軍的決戰過去4年了。
天人組織消失了，世界從3個巨大的國家聯盟統一爲一個聯合政府，世界已經統一。但是，這只是表象。表面的政治統一，但軍方祕密組織A-LAWS在暗中從事武裝鎮壓，鎮壓所有反對聯合政府的組織與團體。這樣的世界，沒有改變。人類依然沒有從戰爭、紛爭、矛盾之中解脫出來。天人組織再次回歸！高達駕駛員剎那•F•清英駕駛新型號的機器人——高達00再次武力介入。這次，天人組織要面對的不僅是A-LAWS的機動戰士部隊，還有神祕組織變革者——其首領里馮茲正在計劃一個更大的陰謀！
《機動戰士高達00》系列動畫片第2季。