一直想尋根的超人（Brandon Routh飾）返回了氪星，希望可以找到其他同伴，但那裡的一切早已不復存在。而這一去便是5年。
5年後，超人回到了地球，但是周遭的一切已經改變。他發現地球已經習慣了沒有超人的保護，他一直愛慕的路易絲（Kate Bosworth飾）因爲饌寫了一篇「爲什麼世界不需要超人」的報導而獲得普利茲大獎。更令他心碎的是，她已經與主編的侄子訂婚，而且是一個5歲孩子的母親了。
另一邊，他的死對頭萊克斯（Kevin Spacey飾）利用卑鄙手段騙取了巨額遺產，企圖捲土重來。在南極萊克斯找到了超人父親的線索，以及一塊含有超級能量的水晶，妄想藉助水晶的力量控制地球。
超人能否戰勝心魔，再一次挽救地球於水火？