行駛於太平洋上的運輸船海龍丸遭遇奇怪的環礁,保險公司的草薙直哉(小野寺昭 飾)和海上保安廳的米森良成(伊原剛志 飾)奉命前去調查。他們在環礁上發現了神祕的碑文和飾品,不久,環礁發生劇烈抖動,俄而竟化作一隻巨龜,互相飛向空中。另一方面,位於九州的姫神島嶼大陸失去聯繫。鳥類學家長峯真弓(中山忍 飾)與刑警大迫力(螢雪次朗 飾)前去尋找失蹤的平田教授,卻在當地遭遇三隻以人類爲食的巨型怪鳥。在內閣的授意下,自衛隊對怪鳥展開圍捕,而就在這個恐慌的夜晚,巨龜也出現在陸地上,與怪鳥展開驚天動地的搏殺……
本片榮獲第17屆橫濱電影節最佳導演、最佳女配角(中山忍)、最佳腳本和最佳技術四項大獎;第19屆日本電影學院獎最佳女配角獎;1995年電影旬報十佳影片第6名,也是80年來唯一一部入選旬報十佳的怪獸電影。